بر اساس گزارش اداره روابط عمومی و همکاری های علمی بین المللی پایگاه استنادی علوم جهان اسلامISC، گروه رتبه بندیISC، در سال 1398 دانشگاه ها و موسسات پژوهشی کشور را برای نهمین سال متوالی به صورت رسمی بر اساس ۲۳شاخص در قالب ۵معیار کلی پژوهش، آموزش، وجهه بین­المللی، تسهیلات و فعالیت های اجتماعی- اقتصادی رتبه­بندی نمود. شاخص ها و معیارهای رتبه­بندی و متدولوژی محاسبه رتبه بندی مربوطه و نیز وزن اختصاص یافته به هر شاخص و مؤلفه های آن مصوب ششمین نشست فوق­العاده وزاری آموزش عالی کشورهای اسلامی است که توسط خبرگان علم رتبه­بندی تهیه و تدوین شده اند.

اطلاعات پژوهش رتبه بندی سال 98-97 مربوط به بازه زمانی 2017-2015 و اطلاعات پرسشنامه مربوط به بازه زمانی 1396-1394 می باشد. 

دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی مانند سال های گذشته موفق به کسب رتبه دوم در بین دانشگاه ها و موسسات تحقیقاتی تحت پوشش وزارت بهداشت درمان و آموزش پزشکی شد.